Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SART1O43290 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SART1O43290 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SART1O43290 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SART1O43290 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SART1O43290 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SART1O43290 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SART1O43290 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SART1O43290 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms