Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLXNB1O43157 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PLXNB1O43157 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms