Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARPC5O15511 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARPC5O15511 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms