Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ANKRD28O15084 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ANKRD28O15084 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms