Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CEP290O15078 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEP290O15078 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEP290O15078 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEP290O15078 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP290O15078 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP290O15078 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP290O15078 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP290O15078 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CEP290O15078 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP290O15078 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP290O15078 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP290O15078 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEP290O15078 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEP290O15078 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEP290O15078 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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