Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SOCS3O14543 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SOCS3O14543 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms