Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAPO00193 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAPO00193 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAPO00193 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAPO00193 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMAPO00193 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAPO00193 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAPO00193 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAPO00193 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAPO00193 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAPO00193 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAPO00193 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMAPO00193 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMAPO00193 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMAPO00193 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMAPO00193 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMAPO00193 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMAPO00193 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMAPO00193 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMAPO00193 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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