Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARVCFO00192 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARVCFO00192 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms