Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E9PMD0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E9PMD0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E9PMD0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E9PMD0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E9PMD0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
E9PMD0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E9PMD0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PMD0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PMD0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E9PMD0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms