Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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USP17L23D6RBM5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP17L23D6RBM5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP17L23D6RBM5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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