Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRT4C9JH25 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRRT4C9JH25 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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