Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VGLL3A8MV65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms