Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC169A6NNP5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms