Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM247A6NEH6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM247A6NEH6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms