Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL33A6NCF5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL33A6NCF5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms