Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRD1A4D1F6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRD1A4D1F6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms