Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PRAMEF27A3QJZ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF27A3QJZ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms