Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPDC1A2A3K4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPDC1A2A3K4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms