Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RRM2P2-201ENST00000436212 652 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SNCA-208ENST00000505199 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AL645949.2-201ENST00000513434 786 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC142391.1-201ENST00000515823 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AP000911.1-204ENST00000533091 571 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AP000812.3-201ENST00000544535 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC013403.2-201ENST00000607659 480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HSD3B2-201ENST00000369416 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AP005242.4-201ENST00000623533 2529 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC007906.2-202ENST00000619363 1687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 RAD51C-201ENST00000337432 2591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PRAMEF12-201ENST00000357726 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PAK3-206ENST00000425146 2477 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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