Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SCAMP1-AS1-202ENST00000513755 493 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC114321.1-201ENST00000520075 533 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 DIO1-202ENST00000361921 1861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CHMP3-204ENST00000409727 1851 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 LINC01898-201ENST00000564156 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MPP4-204ENST00000409143 2082 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TUT1-202ENST00000308436 2826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 EEF2KMT-202ENST00000458008 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 OR4X1-201ENST00000320048 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 YBX1P7-201ENST00000436766 535 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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