Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ADAM1B-201ENST00000454683 2000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ALDH8A1-201ENST00000265605 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 THAP1-201ENST00000254250 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SPOP-205ENST00000503676 1932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AP005242.4-201ENST00000623533 2529 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MPI-207ENST00000563422 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RN7SL732P-201ENST00000581157 300 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC245884.9-201ENST00000596631 483 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC130456.7-201ENST00000623838 1256 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL359532.1-201ENST00000608729 1560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 DUXAP8-202ENST00000413768 2102 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 ZNF542P-207ENST00000495307 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 BPIFB9P-201ENST00000246222 1178 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 DNAL4-202ENST00000406199 631 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC104445.1-201ENST00000460597 749 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LMO3Q8TAP4 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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