Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U3KQE9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
U3KQE9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
U3KQE9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U3KQE9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms