Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms