Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR2E3Q9Y5X4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms