Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX10Q9Y5X0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms