Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms