Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB12Q9Y5F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms