Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A5

TRRAP, Transformation/transcription domain-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRRAPQ9Y4A5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRRAPQ9Y4A5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRRAPQ9Y4A5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms