Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms