Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRP7AQ9Y3A4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRP7AQ9Y3A4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRP7AQ9Y3A4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms