Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP11BQ9Y2G3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11BQ9Y2G3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11BQ9Y2G3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms