Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC4Q9Y296 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC4Q9Y296 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms