Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHOC2Q9UQ13 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
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