Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAMD4AQ9UPU9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAMD4AQ9UPU9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms