Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM33Q9UPN9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM33Q9UPN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms