Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
L1RE1Q9UN81 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
L1RE1Q9UN81 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms