Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP17Q9ULZ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP17Q9ULZ9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP17Q9ULZ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP17Q9ULZ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP17Q9ULZ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP17Q9ULZ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP17Q9ULZ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms