Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RIMKLBQ9ULI2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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