Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH7Q9ULB5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH7Q9ULB5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH7Q9ULB5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms