Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN16Q9UKR8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN16Q9UKR8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms