Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP21Q9UK80 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP21Q9UK80 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP21Q9UK80 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP21Q9UK80 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP21Q9UK80 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP21Q9UK80 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms