Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MID2Q9UJV3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms