Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED13Q9UHV7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED13Q9UHV7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms