Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IRD1Q9UHL9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF2IRD1Q9UHL9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms