Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC3BQ9UH17 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBEC3BQ9UH17 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms