Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TRPC4Q9UBN4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRPC4Q9UBN4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms