Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAE1Q9UBE0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAE1Q9UBE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms