Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL42Q9P2K6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.33■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms