Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ABRACLQ9P1F3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ABRACLQ9P1F3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms