Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EHD2Q9NZN4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EHD2Q9NZN4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms